Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
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NCOA1Q15788 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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NCOA1Q15788 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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