Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms