Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TRADDQ15628 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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TRADDQ15628 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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