Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCEA2Q15560 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCEA2Q15560 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms