Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CDSNQ15517 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDSNQ15517 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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