Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD1Q15327 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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