Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms