Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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