Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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