Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC10A1Q14973 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms