Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSPNQ14714 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSPNQ14714 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSPNQ14714 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SSPNQ14714 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SSPNQ14714 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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