Protein–RNA interactions for Protein: Q14194

CRMP1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRMP1Q14194 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRMP1Q14194 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRMP1Q14194 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms