Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms