Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPA4Q13156 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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