Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FOXF2Q12947 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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