Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
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GRIN2AQ12879 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
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GRIN2AQ12879 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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GRIN2AQ12879 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
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GRIN2AQ12879 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
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GRIN2AQ12879 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
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