Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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