Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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