Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms