Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms