Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms