Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms