Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms