Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms