Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN12Q05209 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms