Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms