Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms