Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms