Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD1P98174 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms