Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL8P80075 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL8P80075 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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