Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX6P78412 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX6P78412 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms