Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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