Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms