Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA9P57773 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA9P57773 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms