Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms