Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO3P55854 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms