Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHB4P54760 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms