Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CENPFP49454 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPFP49454 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CENPFP49454 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CENPFP49454 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CENPFP49454 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CENPFP49454 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPFP49454 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPFP49454 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPFP49454 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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