Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FNTBP49356 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTBP49356 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTBP49356 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms