Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTRNP46939 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms