Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCAMP43121 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCAMP43121 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCAMP43121 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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