Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CBP42338 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms