Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB2P26583 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms