Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCL3P20749 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms