Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms