Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRAP18433 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRAP18433 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRAP18433 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRAP18433 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRAP18433 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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