Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms