Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPBP14678 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms