Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms