Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms